Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRC17Q8N6Y2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LRRC17Q8N6Y2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRRC17Q8N6Y2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LRRC17Q8N6Y2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LRRC17Q8N6Y2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LRRC17Q8N6Y2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LRRC17Q8N6Y2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LRRC17Q8N6Y2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRC17Q8N6Y2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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