Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HERC6Q8IVU3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms