Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX20Q7Z614 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms