Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms