Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LRIG3Q6UXM1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LRIG3Q6UXM1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms