Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZBED9Q6R2W3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
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