Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF7Q6Q0C0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms