Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HMBOX1Q6NT76 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMBOX1Q6NT76 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms