Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL2Q6F5E8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms