Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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C9orf135Q5VTT2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
C9orf135Q5VTT2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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