Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC01545Q5VT33 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC01545Q5VT33 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms