Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TDRD12Q587J7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms