Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ZBED5Q49AG3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms