Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ISXQ2M1V0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms