Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CSPP1Q1MSJ5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms