Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRNQ16849 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms