Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA9Q16795 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA9Q16795 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms