Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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ECM1Q16610 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ECM1Q16610 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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