Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACKR1Q16570 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms