Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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SNAPC1Q16533 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SNAPC1Q16533 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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