Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GABRA6Q16445 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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GABRA6Q16445 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
GABRA6Q16445 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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