Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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GRIK4Q16099 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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GRIK4Q16099 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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