Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6AP1Q15904 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP6AP1Q15904 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms