Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCOA1Q15788 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCOA1Q15788 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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