Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDCD1Q15116 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PDCD1Q15116 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PDCD1Q15116 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PDCD1Q15116 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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