Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TRAM2Q15035 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAM2Q15035 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms