Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC3Q15034 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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