Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
R3HDM1Q15032 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
R3HDM1Q15032 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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