Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CAPSQ13938 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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