Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RUNX3Q13761 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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