Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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HDAC1Q13547 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HDAC1Q13547 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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