Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD4Q13485 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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