Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XRCC4Q13426 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms