Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE3BQ13370 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms