Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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PTPRSQ13332 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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PTPRSQ13332 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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PTPRSQ13332 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTPRSQ13332 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTPRSQ13332 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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PTPRSQ13332 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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PTPRSQ13332 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTPRSQ13332 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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