Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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