Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MKRN3Q13064 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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