Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN1Q12860 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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