Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
TWF1Q12792 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TWF1Q12792 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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