Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AP1B1Q10567 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms