Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RBBP4Q09028 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms