Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC1Q08554 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms