Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FMODQ06828 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
FMODQ06828 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms