Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms