Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NOTCH2Q04721 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NOTCH2Q04721 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NOTCH2Q04721 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NOTCH2Q04721 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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