Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POU5F1Q01860 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms