Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IFITM3Q01628 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms