Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDC42EP1Q00587 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDC42EP1Q00587 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms