Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HERVK_113P63121 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms