Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRP54P61011 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRP54P61011 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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